1999年，由于数码世界资料异常增生，导致数码世界和现实世界的连接发生紊乱。地球上相应地出现奇怪的自然现象：东南亚没有下雨，池塘全部干涸；中东却因为连场大雨发生洪水；美国则遇到有史以来最寒冷的冬天。　　11岁的少年八神太一（藤田淑子 配音），和伙伴石田大和（风间勇刀 配音）、武之内空（水谷优子

　　在纽约出现了一只神秘的数码兽，他利用自己特殊的力量将太一、阿和、阿空、光子郎、美美、阿丈带到了一个陌生的世界。同时，在纽约的八神光和高石武发现了这只数码兽，并且看到一个美国小孩与数码兽对话之后逃走的情况。巴达兽悄悄地尾随其后，得知这个小孩要去一个叫“花场”的地方寻找“夏天的回忆”。大家赶至那里。

　　被突如奇来的宇宙侵略者S．E侵占地表以来，已经过了一百年，现在是新西历302年。人类仍然不知道侵略者的真正面目，少数人潜入海底深处的AQUABASE中苟延残喘活下来。

　　故事發生在1969年的日本，主角淺蔥まりん是個孤兒，與拾她回來的婆婆，和在長屋居住的人們相依為命。雖然家貧困累受人欺負，但她還是毫不氣餒努力求生。　　某一日，來自異世界的生化兵器突然攻擊まりん，逃避中的まりん，因ロロ的幫助在神社中拿起寶瓶，誤打誤撞下喚醒封在其中的異世界生化兵器，男主角メラン‧ブ

　　Ova故事是朱雀与青龙的战争结束几个月后:鬼宿在战争结束仍活在现实世界里,他与美朱和奎介到盛冈替玄武巫女扫墓时,突然间鬼宿被玄武巫女的声音引导下突然地消失了,他醒来时惊见自己已身处「红南国」……,而且还过了50年……

　　不思议游戏OVA2延续篇 / 不可思议的游戏OVA2延续篇

　　美朱高中毕业后与魏婚后怀孕，本应享受美好生活，但暗恋魏之女学生意外得到四神天地书，开启后进入书中，并想取代美朱成为朱雀巫女，目的是改写历史，夺去美朱的一切包括她的身份。可是这样会令美朱的胎儿及性命随时不保，知道事情的魏为了拯救美朱将再次进入四神天地书。可是当他到达里面却发现世界被一层阴霾所覆盖，

　　夕城美朱（荒木香惠 配音）是一名普通的高中生，一日，她正和好友本乡唯（冬马由美 配音）在图书馆看书，两人无意间翻开了一本名叫《四神天地书》的古书，一道红光闪过，两人被吸入书中，穿越到了一个架空的时代。在那里，美朱的身份不再平凡，她摇身一变，成为了人们口中的朱雀巫女，而朱雀巫女的任务便是找齐传说中

　　高二那年夏天，美丽的女孩武藤里伽子（坂本洋子 配音）随母亲离开大都会东京，来到了古朴幽静的高知。聪慧美丽的里伽子在这个偏僻的小地方如此靓丽，引来了男孩们的爱恋的目光，而她孤高的性格又让女孩们颇多微词。与她同班的班长松野丰（関俊彦 饰）偷偷喜欢着她，而松野的好友杜崎拓（飛田展男 饰）似乎也对里伽子

　　在太一一行人告别数码世界后，数码世界并没有就此关闭朝向人类的大门，而数码世界的内部却没有太平多少时日，就又开始了纷争。　　数码世界急需一批被选中的孩子来维护数码世界和人类世界的和平。太一、阿和、素娜等人都已先后成为了初中生，没有太多精力和时间能够和数码宝贝们一起并肩作战，只有阿武和小光成为了新一